Khu phức hợp bảo tàng là một nhà máy điện được xây dựng lại từ đầu thế kỷ 20, một cấu trúc bằng gạch với lối trang trí trát vữa tân cổ điển, trong đó các hình thức kết tinh đặc trưng của Libeskind được nhúng vào. Nhìn từ bên ngoài, chúng giống như những khối thép không gỉ màu xanh hình khối và dài nhô ra từ các tầng của tòa nhà. Chúng có dạng hai chữ cái trong bảng chữ cái tiếng Do Thái - "hat" và "iod", cùng tạo thành phương châm trong dự án L'Chaim của Libeskind, có nghĩa là "để sống". Tuy nhiên, chúng chỉ có thể đọc được nếu bạn nhìn vào tòa nhà từ trên cao, điều mà khách tham quan bảo tàng bình thường không thể tiếp cận được.
Trong tiền sảnh của bảo tàng, bức tường đối diện với lối vào được trang trí bằng những đường phù điêu nổi bật tạo thành từ "pardes", có nghĩa là "Vườn Địa đàng", và cũng tượng trưng cho bốn cấp độ hiểu kinh Torah. Nhưng yếu tố này của dự án cũng được nhìn nhận khó khăn do không gian sảnh có những khúc cua gấp.
Trên chính - tầng đầu tiên của khu phức hợp - cũng có một khán phòng (trên trần nhà có bản đồ của Đất Thánh được mô tả một cách trừu tượng), một trung tâm giáo dục và các phòng trưng bày. Trên tầng hai có các cơ sở hành chính, cũng như một phòng triển lãm cùng tên được khắc bằng một hình khối khổng lồ của chữ "i-ốt", được chiếu sáng qua 36 cửa sổ đa giác.
Bản thân Libeskind nhấn mạnh sự khác biệt giữa tòa nhà ở San Francisco và các bảo tàng Do Thái của ông ở Thế giới cũ: tòa nhà ở California không có dấu vết của thảm họa Holocaust, thứ nhất thiết phải có trong các dự án ở châu Âu của ông. Tuy nhiên, ngôn ngữ kiến trúc của Libeskind vẫn được giữ nguyên: những đường nét đứt gãy trước đây tượng trưng cho bi kịch lịch sử nay lại đại diện cho "gian hàng của thiên đường" của một cộng đồng Do Thái thịnh vượng trên bờ biển Thái Bình Dương.
